Stavns Fjord er en næsten rund fjord på Samsø, der ligger mellem Nord- og Sydsamsø, med tangen, der forbinder dem, som den vestlige afgrænsning. Den har et areal på cirka 20 km² med indløb nordfra mellem Lilleøre på Nordsamsø og Besser Rev. Det cirka 5 kilometer lange Besser Rev, der udgår fra sydøen, danner en naturlig beskyttelse af den lavvandede fjord og dens mange småøer og holme. Navnet Stavns, tidligere Stauffnes, på landsbyen inde i fjorden, er en forvanskning af norrønt Stafnes (dvs. "Stavnæs"), et stednavn, der også kendes fra Island.[1]
Midt i fjorden ligger den største ø, Hjortholm, og de mindre, lave øer Karlskold, Mejlesholm, Yderste Holm og Kolderne. Nordvest i fjorden ligger Sværm, Ægholm og Hundsholm. I syd ligger de lave øer Eskeholm, Brokold og Barnekold, som har landforbindelse ad en ebbevej. (Der er omkring 30 centimeters tidevandsforskel.)